More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0244 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  100 
 
 		 449 aa  917    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  34.95 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  34.95 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  34.95 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  34.95 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  31.4 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  31.4 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  31.4 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  31.4 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  31.4 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  31.4 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  40.28 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  37.04 
 
 		 325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  31.33 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  37.04 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  33.55 
 
 		 310 aa  128  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  33.65 
 
 		 326 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  34.6 
 
 		 309 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  38.83 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  35.42 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  31.75 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  34.17 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  34.17 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  34.17 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  33.88 
 
 		 322 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  33.55 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  34.95 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  30.33 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  34.93 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  30.58 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  31.89 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  30.43 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  27.76 
 
 		 321 aa  103  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0439  phage integrase  29.62 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  33.49 
 
 		 312 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  34.31 
 
 		 332 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 		 312 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  34 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  34 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  34 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  34 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  32.67 
 
 		 304 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  23.15 
 
 		 324 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  28.57 
 
 		 325 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  34.25 
 
 		 303 aa  89.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  34.25 
 
 		 303 aa  89.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  25.08 
 
 		 323 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.1 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  27.1 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3671  phage integrase family protein  30 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.05 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3693  integrase family protein  23.65 
 
 		 321 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  28.71 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.86 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.21 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3642  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  29.27 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  27.32 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  26.82 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.48 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3617  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.39 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3710  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.61 
 
 		 315 aa  62.8  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  31.66 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  31.79 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  27.01 
 
 		 300 aa  63.2  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  31.02 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2821  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.626713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  29.5 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2215  hypothetical protein  25.16 
 
 		 621 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000394108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  30.19 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  25.11 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  31.79 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  28.36 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  26.83 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.06 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  27.23 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  26.83 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.21 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.21 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.21 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  29.27 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  27.43 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  28.24 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  30.23 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  31.19 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>