96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3313 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  59.94 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  31.01 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  25.44 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  25.44 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  25.44 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  25.09 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  30.3 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  26.96 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  26.36 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  23.94 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  23.59 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  24.88 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  27.56 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  26.57 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  25.26 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  24.88 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  30.48 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  27.11 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  28.7 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  28.31 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  32.42 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  36.24 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  28.1 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  32.35 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  31.03 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  31.79 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  32.96 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  24.88 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  30.1 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  30.43 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  29.19 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  29.57 
 
 		 600 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  26.5 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  24.44 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  31.79 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  21.91 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  27.24 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  26.58 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  32.56 
 
 		 257 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  24.68 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  33.76 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  29.23 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  35.44 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  25.84 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  37.78 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  25.7 
 
 		 297 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  35.14 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  24.52 
 
 		 347 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  25.41 
 
 		 266 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6950  hypothetical protein  28.64 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3446  hypothetical protein  24.85 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2989  hypothetical protein  25.94 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  24.32 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  27.36 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  25.84 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  25.97 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3397  hypothetical protein  24.85 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  31.47 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0947  hypothetical protein  27.06 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0105052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  34.03 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  31.13 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0467  hypothetical protein  23.86 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  29.23 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  32.85 
 
 		 234 aa  46.2  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3800  hypothetical protein  24.7 
 
 		 267 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  30 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  23.98 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  33.9 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  29.77 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  27.87 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  26.6 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  31.36 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1515  hypothetical protein  24.7 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  28.67 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3342  hypothetical protein  30.63 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.162621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  23.28 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  27.87 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  27.08 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4771  hypothetical protein  34.82 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.6863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4429  hypothetical protein  34.82 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  31.52 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0536  hypothetical protein  25.31 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00433962  hitchhiker  0.0000000000000544331 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0163  hypothetical protein  20.88 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4063  hypothetical protein  29.72 
 
 		 714 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  25.35 
 
 		 258 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0639  hypothetical protein  26.01 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  27.18 
 
 		 276 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  26.75 
 
 		 221 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3709  hypothetical protein  21.04 
 
 		 268 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12968e-17 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  25.56 
 
 		 219 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3378  hypothetical protein  24.59 
 
 		 267 aa  42.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  29.1 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  25.14 
 
 		 417 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>