47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4362 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  36.69 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  36.69 
 
 		 318 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  37.13 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  36.69 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  35.5 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  34.6 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  34.42 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  36.03 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  34.81 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  36.18 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  34.85 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  34.85 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  34.49 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  32.06 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  33.77 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  32.48 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  30.03 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  24.92 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  26.16 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  24.52 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  24.44 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  28.18 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  27.84 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  26.49 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  24.1 
 
 		 275 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3397  hypothetical protein  34.07 
 
 		 267 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3446  hypothetical protein  34.07 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3800  hypothetical protein  34.07 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1515  hypothetical protein  34.07 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  24.52 
 
 		 251 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  24.41 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  26.24 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  26.72 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  28.31 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  22.51 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  24.14 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  23.89 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  26.57 
 
 		 600 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  23.12 
 
 		 258 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  23.2 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  22.63 
 
 		 258 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3751  hypothetical protein  32.85 
 
 		 268 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>