55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3729 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  626  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  56.09 
 
 		 314 aa  345  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  49.02 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  47.62 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  47.96 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  47.96 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  47.96 
 
 		 318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  46.94 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  46.6 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  47.62 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  46.6 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  46.23 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  46.1 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  41.75 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  43.69 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  32.56 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  33.77 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  28.98 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  27.44 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  27.44 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  27.4 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  31.76 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  28.14 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  23.86 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  23.57 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  28.81 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  28.48 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  26.58 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  26.5 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  26.67 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3221  hypothetical protein  26.1 
 
 		 514 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  26.06 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  24.29 
 
 		 600 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  23.72 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  23.26 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  23.79 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  24.86 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  27.27 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  24.27 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  28.1 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4063  hypothetical protein  25.88 
 
 		 714 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  24.2 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  24.02 
 
 		 288 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  24.88 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  25.38 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  31.45 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  28.39 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3342  hypothetical protein  24.02 
 
 		 232 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.162621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  31.53 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  21.13 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3351  hypothetical protein  25 
 
 		 670 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  22.78 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  30.97 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>