62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0761 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  93.71 
 
 
318 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  93.08 
 
 
318 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  87.74 
 
 
318 aa  568  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  79.11 
 
 
318 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  74.53 
 
 
318 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  74.53 
 
 
318 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  73.9 
 
 
318 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  74.21 
 
 
318 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  47.59 
 
 
312 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  48.68 
 
 
315 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  47.62 
 
 
315 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  46.95 
 
 
314 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  47.9 
 
 
313 aa  279  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  45.52 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  35.5 
 
 
321 aa  179  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  33.87 
 
 
321 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  29.35 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  28.78 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  23.8 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  29.27 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  23.76 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  24.88 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  25.54 
 
 
258 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  33.67 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  25.45 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  32.35 
 
 
275 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  24.09 
 
 
265 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  31.21 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  23.75 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  21.92 
 
 
281 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  22.84 
 
 
260 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  23.08 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  23.94 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  23.04 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  26.79 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  25.4 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  24.38 
 
 
254 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  31.82 
 
 
274 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  25.82 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  28.43 
 
 
293 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  28.12 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  29.03 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  26.12 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  26.37 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  23.7 
 
 
307 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  23.79 
 
 
297 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  25.9 
 
 
350 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  23.4 
 
 
256 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3342  hypothetical protein  22.95 
 
 
232 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.162621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  31.65 
 
 
266 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  29.06 
 
 
275 aa  46.2  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  23.31 
 
 
297 aa  45.8  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  22.37 
 
 
417 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  29.06 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  24.87 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  29.32 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  27.88 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  22.81 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  24.52 
 
 
456 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  29.07 
 
 
281 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2390  hypothetical protein  35.8 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.375551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>