53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3506 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  56.09 
 
 		 315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  52.24 
 
 		 315 aa  325  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  49.34 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  49.01 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  49.01 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  48.68 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  47.59 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  48.23 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  49.48 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  46.95 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  48.34 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  47.9 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  44.18 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  32.48 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  30.09 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  27.83 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  29.03 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  24.92 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  22.81 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  28.83 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  22.22 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  27.93 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  26.34 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  23.15 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  24.02 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  22.96 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  26.06 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  24.9 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  24.68 
 
 		 337 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  26.67 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  22.58 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  22.83 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  19.82 
 
 		 350 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  28.17 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3221  hypothetical protein  24.07 
 
 		 514 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  23.13 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 258 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1859  hypothetical protein  26.95 
 
 		 397 aa  45.8  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000288231  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  33.91 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  26.7 
 
 		 456 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  23.23 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  26.45 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  27.64 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  22.6 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  24.59 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  32.61 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  24.5 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  29.93 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  28.17 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  33.04 
 
 		 261 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>