75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35900 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  639    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  40.32 
 
 
350 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  37.47 
 
 
323 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  40.34 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  39.71 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  27.32 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  35.64 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  26.47 
 
 
417 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  34.18 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  33.93 
 
 
265 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  35.44 
 
 
274 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  32.64 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  39.31 
 
 
268 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  30 
 
 
417 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  33.85 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  28.14 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  30.56 
 
 
277 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  29.68 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  31.37 
 
 
298 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  28.02 
 
 
267 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  28.21 
 
 
262 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  33.88 
 
 
229 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  25.77 
 
 
257 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  24.87 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  24.34 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  24.87 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  25.56 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  25.9 
 
 
251 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  28.46 
 
 
260 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  23.74 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  30.73 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  26.34 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  24.87 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  24.87 
 
 
318 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  22.22 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  28.03 
 
 
258 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  36.97 
 
 
280 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  27.57 
 
 
309 aa  50.4  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  28.03 
 
 
258 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  25.4 
 
 
318 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  27.27 
 
 
258 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  35.9 
 
 
276 aa  49.3  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  31.34 
 
 
296 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  35.37 
 
 
281 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  29.79 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  37.04 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  24.27 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  25.9 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  26.35 
 
 
252 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  32.69 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  27.96 
 
 
257 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  25.49 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  28.15 
 
 
281 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  25.76 
 
 
258 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  23.31 
 
 
312 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  34.03 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  31.39 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  32.2 
 
 
231 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  20.41 
 
 
257 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  34.81 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  28 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  23.27 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  25.9 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  27.42 
 
 
258 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  28.8 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  28 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  33.66 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  34.45 
 
 
358 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  25.98 
 
 
251 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  25.45 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1363  hypothetical protein  27.86 
 
 
248 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384055  normal  0.691326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  24.1 
 
 
260 aa  43.5  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  29.09 
 
 
275 aa  42.7  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  23.2 
 
 
321 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>