50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3740 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  42.58 
 
 		 322 aa  248  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  32.56 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  35.39 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  33.87 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  34.19 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  34.32 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  32.06 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  34.74 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  34.42 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  34.42 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  33.99 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  32.67 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  30.09 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  33 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  31.76 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  29.47 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  26.98 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  25.26 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  24.59 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  25.1 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  25.45 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  29.1 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  33.62 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  26.1 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  25.66 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  27.52 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  23.32 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  37.21 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  31.69 
 
 		 600 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  26.83 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  29.33 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  30.52 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  26.42 
 
 		 280 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  27.82 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  27.78 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  27.22 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  31.86 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  24.85 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  21.74 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0163  hypothetical protein  38.24 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  24.09 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  21.27 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  23.97 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  29.21 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  26.2 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  22.39 
 
 		 280 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  28.21 
 
 		 350 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 514 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>