58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0820 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  100 
 
 		 258 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  44.94 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  41.6 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  42.24 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  43.33 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  43.46 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  39.59 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  43.46 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  43.46 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  45 
 
 		 260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  44.58 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  44.4 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  42.74 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  35.29 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  27.75 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  26.56 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  26.58 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  26.62 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  24.75 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  27 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  25.88 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  26.49 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  25.84 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  28.36 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  25.16 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  24.36 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  26.67 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  20.7 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  33.07 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  23.35 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  30.84 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  23.66 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  27.89 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  23.66 
 
 		 318 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  23.38 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  23.76 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  25.96 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  25.78 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  22.67 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  22.84 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  23.63 
 
 		 350 aa  46.2  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2623  putative secreted protein  28.07 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0372245  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  21.67 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  27.42 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  27.66 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  24.27 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  23.39 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  23.12 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  24.84 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  24.88 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  26.02 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  24.07 
 
 		 315 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  25.98 
 
 		 417 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  24.28 
 
 		 313 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>