56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2084 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  43.71 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  44.33 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  39.86 
 
 		 282 aa  188  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  39.79 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  35.56 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  39.93 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  35.46 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  36.04 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  34.98 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  32.74 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  31.1 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  32.14 
 
 		 223 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  31.79 
 
 		 223 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  31.79 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  30.66 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  37.5 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  31.43 
 
 		 221 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  29.88 
 
 		 222 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  28.86 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  32.73 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  27.27 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  31.1 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  25.84 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  29.46 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  33.08 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  28.14 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  27.64 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  20.7 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  23.84 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  29.61 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  26.28 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  23.03 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  23.33 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  26.51 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  25.68 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  22.06 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  22.98 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  29.01 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  32 
 
 		 600 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  25.32 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  30.41 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  21.12 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  27.7 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3221  hypothetical protein  25.88 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  22.98 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  22.98 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  21.12 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  21.12 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  22.84 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  22.98 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  21.74 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  27.84 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  29.07 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  25.74 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.048083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>