35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4759 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  66.93 
 
 		 251 aa  317  9e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  53.52 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  55.79 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  53.52 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  53.12 
 
 		 258 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  52.73 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  50.97 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  51.75 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  51.34 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  50.77 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  50.38 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  51.34 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  52.07 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  45.02 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  41.6 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  25.52 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  26.76 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  21.78 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  25.84 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  22.45 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  26.23 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  26.94 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  26.38 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  25.53 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  26.35 
 
 		 348 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  27.83 
 
 		 274 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  28.97 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  22.64 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  23.17 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  27.35 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  25.83 
 
 		 347 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  24.43 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  36.07 
 
 		 417 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2623  putative secreted protein  24.91 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0372245  normal  0.175706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>