28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0143 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  100 
 
 		 258 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  98.84 
 
 		 258 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  98.06 
 
 		 258 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  89.15 
 
 		 258 aa  454  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  79.3 
 
 		 257 aa  390  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  81.99 
 
 		 260 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  81.68 
 
 		 261 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  81.99 
 
 		 260 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  81.3 
 
 		 261 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  59.15 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  53.52 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  51.97 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  53.04 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  54.42 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  47.11 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  43.88 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  28.07 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  28.46 
 
 		 417 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  26.72 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  28.03 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  24.78 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  20.74 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  22.6 
 
 		 277 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  22.77 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  26.28 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  22.98 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  26.58 
 
 		 257 aa  42  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  29.13 
 
 		 368 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>