33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0144 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  100 
 
 
260 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  97.69 
 
 
260 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  96.55 
 
 
261 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  95.4 
 
 
261 aa  460  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  83.85 
 
 
257 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  83.4 
 
 
258 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  83.4 
 
 
258 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  82.63 
 
 
258 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  79.69 
 
 
258 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  50.38 
 
 
252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  53.59 
 
 
251 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  49.03 
 
 
256 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  49.6 
 
 
251 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  50.68 
 
 
257 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  44.8 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  45 
 
 
258 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  27.23 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  25.53 
 
 
417 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2623  putative secreted protein  29.06 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0372245  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  25.88 
 
 
297 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  28.46 
 
 
348 aa  52.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  26.44 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  25.87 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  31.82 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  21.67 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  24.44 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  26.71 
 
 
229 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  27.46 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  18.52 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  21.12 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  20.37 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  27.82 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  23.02 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>