28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0757 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  100 
 
 		 257 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  54.42 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  54.42 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  53.12 
 
 		 251 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  54.42 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  47.69 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  52.07 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  47.96 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  50 
 
 		 257 aa  201  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  51.39 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  49.09 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  50.45 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  50.45 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  50.68 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  50.23 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  42.24 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  29.14 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  31.14 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  25.77 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  26.85 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  26.32 
 
 		 347 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  24.85 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  25.13 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  28.7 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  27.08 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  24.82 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0221  hypothetical protein  24.53 
 
 		 312 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  29.2 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>