72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3530 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  27.54 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  29.35 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  27.64 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  28.65 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  41.28 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  29 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  31.4 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  28.35 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  27.08 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  29.38 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  28.11 
 
 
417 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  32.18 
 
 
456 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  28.1 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  25.81 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  24.06 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  34.69 
 
 
258 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  24.06 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  23.75 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  33.07 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  25.88 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  23.7 
 
 
268 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  30.39 
 
 
358 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  23.75 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  33.33 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  36.51 
 
 
276 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  23.99 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  23.2 
 
 
318 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1396  hypothetical protein  27.21 
 
 
300 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.107997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  27.68 
 
 
350 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  34.97 
 
 
234 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  22.08 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  33.17 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  23.44 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  26.47 
 
 
257 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  23.12 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  22.39 
 
 
277 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  30.77 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  32.32 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  22.36 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  30.39 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  29.66 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1282  hypothetical protein  27.71 
 
 
405 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000743125  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  27.6 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  29.81 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  25.98 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  28.75 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  28.83 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  29.82 
 
 
229 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2513  hypothetical protein  26.54 
 
 
207 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  24.91 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  24.41 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  34.04 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  27.66 
 
 
417 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  22.1 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  28.7 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  29.25 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0467  hypothetical protein  27.48 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0639  hypothetical protein  27.91 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  26.04 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  27.82 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  21.18 
 
 
254 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0221  hypothetical protein  23.53 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  25.8 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  21.13 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0163  hypothetical protein  23.6 
 
 
350 aa  43.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  31.03 
 
 
307 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  27.84 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  30.94 
 
 
267 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0031  hypothetical protein  25.64 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000287545  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  23.13 
 
 
314 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  32.29 
 
 
257 aa  42.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>