35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4215 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  100 
 
 
261 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  98.08 
 
 
261 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  98.85 
 
 
260 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  96.55 
 
 
260 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  83.91 
 
 
257 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  82.44 
 
 
258 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  83.08 
 
 
258 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  82.31 
 
 
258 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  79.01 
 
 
258 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  51.34 
 
 
252 aa  242  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  53.78 
 
 
251 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  49.62 
 
 
256 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  49.41 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  50.45 
 
 
257 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  44.25 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  44.4 
 
 
258 aa  158  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  28 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  24.86 
 
 
417 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  24.5 
 
 
297 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2623  putative secreted protein  28.68 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0372245  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  26.37 
 
 
257 aa  55.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  32.95 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  23.81 
 
 
358 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  26.59 
 
 
276 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  32.32 
 
 
302 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  27.98 
 
 
229 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  19.26 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  24.78 
 
 
231 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  28.12 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  28 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  21.12 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  22.03 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  22.7 
 
 
347 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  22.35 
 
 
283 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>