50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2262 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  44.54 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  32.38 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  32.11 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  30.36 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  28.29 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  29.02 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  27.62 
 
 		 277 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  29 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1364  hypothetical protein  22.39 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.361689  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6950  hypothetical protein  28.26 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  28.82 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  33.59 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5127  hypothetical protein  32.28 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  24.59 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  30.39 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  30.39 
 
 		 318 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5421  hypothetical protein  28.41 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  29.9 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  24.78 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  27.89 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  24.78 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  24.8 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  28.92 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  31.18 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  25.52 
 
 		 350 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  37.76 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  32.2 
 
 		 348 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  24.34 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  24.89 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  23.56 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  24.89 
 
 		 260 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1396  hypothetical protein  30.48 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.107997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  29.06 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  27.07 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  32.76 
 
 		 323 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  24.74 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0262  hypothetical protein  28.8 
 
 		 341 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.221437  normal  0.39253 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1515  hypothetical protein  26.09 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  25.55 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  29.21 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  28.43 
 
 		 318 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  33.87 
 
 		 276 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  23.25 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  29.52 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2279  hypothetical protein  40.24 
 
 		 293 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>