11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5421 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5421  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  28.12 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  23.68 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  29.09 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  29.58 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  32.21 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  25.1 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  28.1 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5127  hypothetical protein  35.09 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  28.23 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1364  hypothetical protein  27.05 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.361689  normal  0.874866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>