28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3868 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  31.7 
 
 		 269 aa  128  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  32.46 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  32.66 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  32.52 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  30.69 
 
 		 307 aa  99.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  26.19 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  25.91 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  26.19 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5421  hypothetical protein  28.97 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  26.61 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  27.63 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  27.08 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1363  hypothetical protein  25.54 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384055  normal  0.691326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1364  hypothetical protein  27.69 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.361689  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  32.47 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  28.3 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  26.32 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4387  hypothetical protein  34.46 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  34.58 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5127  hypothetical protein  31.9 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2279  hypothetical protein  29.82 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  26.51 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  26.5 
 
 		 323 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  28.84 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  31.58 
 
 		 337 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  24.58 
 
 		 275 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>