11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1364 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1364  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  480  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.361689  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1363  hypothetical protein  47.98 
 
 
248 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384055  normal  0.691326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  24.15 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  28.24 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  26.94 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  27.69 
 
 
267 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  23.44 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  33.77 
 
 
318 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  25.14 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5421  hypothetical protein  27.05 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285606  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  36.14 
 
 
323 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>