27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5649 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  527  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  49.07 
 
 
269 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  32.46 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  32.24 
 
 
229 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  33.98 
 
 
268 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  35.12 
 
 
283 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  29.96 
 
 
231 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6950  hypothetical protein  33.77 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  28.17 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  26.58 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1364  hypothetical protein  28.24 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.361689  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  29.31 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5421  hypothetical protein  28.1 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285606  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  29.78 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  26.29 
 
 
307 aa  55.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1363  hypothetical protein  24.77 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384055  normal  0.691326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  29.13 
 
 
337 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5127  hypothetical protein  29.41 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  31.65 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  28.57 
 
 
302 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  31.86 
 
 
318 aa  45.4  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  21.43 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  27.65 
 
 
330 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  26.02 
 
 
350 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  23.79 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  30.93 
 
 
318 aa  42.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  31.86 
 
 
318 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>