32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  455  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  37.92 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6950  hypothetical protein  31.49 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  32.08 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  30.2 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  30.52 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  29.93 
 
 
307 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  32.51 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  27.24 
 
 
267 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  34.97 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  32.33 
 
 
323 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  31.4 
 
 
330 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3378  hypothetical protein  24.88 
 
 
267 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  34.32 
 
 
258 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3800  hypothetical protein  25.12 
 
 
267 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1515  hypothetical protein  22.31 
 
 
267 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  26.82 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0262  hypothetical protein  28.57 
 
 
341 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.221437  normal  0.39253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  27.76 
 
 
350 aa  45.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  30.59 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3446  hypothetical protein  23.79 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  37.5 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3728  hypothetical protein  27.68 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  41.11 
 
 
343 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  31.13 
 
 
276 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3397  hypothetical protein  23.3 
 
 
267 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3755  hypothetical protein  23.67 
 
 
267 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  26.28 
 
 
456 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3709  hypothetical protein  23.67 
 
 
268 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12968e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3481  hypothetical protein  23.67 
 
 
268 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.02728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3751  hypothetical protein  26.79 
 
 
268 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>