23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2299 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  35.12 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  32.52 
 
 		 267 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  28.5 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  31.67 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  32.95 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5421  hypothetical protein  28.12 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  30.37 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  39.42 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  26.56 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  26.51 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0262  hypothetical protein  31.43 
 
 		 341 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.221437  normal  0.39253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  34.04 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  30.59 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  32.23 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  27.07 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  27.88 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  30.3 
 
 		 417 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  31.52 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5127  hypothetical protein  32.88 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  26.36 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  24.72 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  34.48 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>