42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0035 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  100 
 
 		 256 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  53.52 
 
 		 252 aa  258  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  56.86 
 
 		 251 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  51.97 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  54.39 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  51.97 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  51.97 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  49.41 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  48.63 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  48.25 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  48.25 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  50 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  48.45 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  49.09 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  49.33 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  34.13 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  28.7 
 
 		 417 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  28.17 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  29.66 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  25.9 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  24.32 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  24.09 
 
 		 417 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  32.47 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  28.31 
 
 		 358 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  25.84 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  28.68 
 
 		 348 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  23.4 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  25.32 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  29.91 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  27.12 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  27.03 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  24.63 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  24.22 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  30.58 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  24.72 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1968  hypothetical protein  35.59 
 
 		 310 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  29.52 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  25.65 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  23.36 
 
 		 318 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>