37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3912 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  544  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  28.68 
 
 
229 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  30.22 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  28.17 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  29.44 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  27.98 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  27.82 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  36.6 
 
 
243 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  34.59 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  26.19 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  30.2 
 
 
350 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  26.53 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  30.56 
 
 
348 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  26.85 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  29.51 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  26.56 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  29.51 
 
 
318 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  28.96 
 
 
318 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  35.16 
 
 
330 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  23.64 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  28.08 
 
 
323 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  28.96 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5127  hypothetical protein  34.43 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  26.67 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  26.01 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  28.83 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  39.18 
 
 
298 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  28.57 
 
 
318 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  36.08 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  25.27 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  25.56 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  39.05 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6950  hypothetical protein  28.28 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  25 
 
 
322 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  31.37 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  28.33 
 
 
315 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>