47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2958 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  52.24 
 
 		 314 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  47.62 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  47.02 
 
 		 318 aa  291  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  48.01 
 
 		 318 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  47.35 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  47.02 
 
 		 318 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  48.34 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  48.68 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  47.02 
 
 		 318 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  47.62 
 
 		 318 aa  285  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  47.44 
 
 		 313 aa  285  9e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  48.34 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  45.57 
 
 		 312 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  46.76 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  34.49 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  29.71 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  29.47 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  27.13 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  26.18 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  26.57 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  25.74 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  23.53 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  26.74 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  22.69 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  24.65 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  23.24 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  25.71 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  28.65 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  30.36 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  24.4 
 
 		 274 aa  53.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  28.77 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  23.04 
 
 		 350 aa  49.7  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  26.19 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  34.53 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  27.23 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  23.04 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  27.92 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2436  hypothetical protein  27.32 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  24.07 
 
 		 600 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  24.64 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  24.07 
 
 		 258 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  25.5 
 
 		 268 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>