37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0817 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  44.54 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  33.04 
 
 
266 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  33.81 
 
 
268 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  31.73 
 
 
269 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  28.46 
 
 
277 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  29.52 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  31.67 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  25.91 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6950  hypothetical protein  28.95 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  30.52 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1364  hypothetical protein  26.94 
 
 
248 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.361689  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  25.85 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  28.36 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  33.88 
 
 
348 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  24.89 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5421  hypothetical protein  24.24 
 
 
261 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285606  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  28.48 
 
 
307 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  25.84 
 
 
337 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  28.8 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5127  hypothetical protein  27.78 
 
 
236 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  29.82 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  32.09 
 
 
261 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  27.22 
 
 
330 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  30.6 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  30.6 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  27.91 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  29.13 
 
 
260 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  29.7 
 
 
323 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  23.73 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3378  hypothetical protein  24.51 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  27.27 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2390  hypothetical protein  24.12 
 
 
280 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.375551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  28.83 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  25.65 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  22.06 
 
 
323 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  28.46 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>