34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0143 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  100 
 
 
261 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  98.08 
 
 
261 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  97.7 
 
 
260 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  95.4 
 
 
260 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  83.91 
 
 
257 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  82.69 
 
 
258 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  82.69 
 
 
258 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  81.92 
 
 
258 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  78.63 
 
 
258 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  51.34 
 
 
252 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  54.2 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  50 
 
 
256 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  49.01 
 
 
251 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  50.45 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  44.69 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  44.81 
 
 
258 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  29 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  23.7 
 
 
417 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  24.5 
 
 
297 aa  59.3  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2623  putative secreted protein  28.25 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0372245  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  32.95 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  26.57 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  26.92 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  31.31 
 
 
302 aa  48.5  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  20 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  32.09 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  24.78 
 
 
231 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  28.8 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  23.33 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  27.08 
 
 
337 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  24.71 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  22.6 
 
 
323 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  21.74 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>