39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3683 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  557  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  65.6 
 
 
284 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  42.86 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  43.56 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  30.47 
 
 
275 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  31.9 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  28.83 
 
 
275 aa  99  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  30.69 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  30.4 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  31.03 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  28.99 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  32.7 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  30.89 
 
 
358 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  25.71 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  28.24 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  26.71 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  26.71 
 
 
297 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  24.56 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  25.73 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  26.74 
 
 
330 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  29.86 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  25.15 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  24.24 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  24.86 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  26.37 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  25.76 
 
 
309 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  28.39 
 
 
297 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  23.21 
 
 
318 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  21.63 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  27.27 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  27.64 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  27.12 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  26.6 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  24.74 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  28.19 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  23.6 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  24.71 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  24.16 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  24.77 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>