71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4409 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  34.89 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  31.65 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  32.13 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  32.03 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  29.75 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  29.66 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  32.19 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  27.52 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  27.6 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  27.82 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  31.03 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  29.44 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  33.87 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  35.44 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  29.31 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  33.17 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  26.6 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  27.45 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  30.09 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  34.08 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  24.42 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  26.45 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  24.36 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  24.55 
 
 		 229 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  29.7 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  25.72 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  27.8 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  25.6 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  30.05 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  26.95 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  28.5 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  25.52 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  24.82 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  30.15 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  25.12 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 258 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  32.74 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  28.65 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  29.96 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  29.34 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  33.57 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  34.35 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  23.65 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  22.01 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  32.03 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1711  hypothetical protein  27.33 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.597289  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  21.21 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  28.92 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  31.43 
 
 		 692 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  27.88 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  22.15 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  38.28 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  22.02 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  32.12 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  29.23 
 
 		 739 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  22.77 
 
 		 417 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  22.7 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  21.66 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  32.39 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>