49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3102 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  596  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  39.33 
 
 
350 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  38.84 
 
 
348 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  29.41 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  30.67 
 
 
417 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  30.36 
 
 
281 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  29.61 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  25.38 
 
 
347 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  24.07 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  21.46 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  30.85 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3351  hypothetical protein  37.16 
 
 
670 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  29.46 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  24.67 
 
 
258 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  24.42 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  29.17 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  21.39 
 
 
251 aa  52.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  24.83 
 
 
258 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  24.67 
 
 
258 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  21.95 
 
 
251 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  24.24 
 
 
260 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  24.11 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3221  hypothetical protein  30.41 
 
 
514 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  30.26 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  23.33 
 
 
252 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  23.64 
 
 
261 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  24.41 
 
 
350 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  23.64 
 
 
260 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  24.24 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  26.45 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  28.78 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  30.73 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  29 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  27.37 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  30.33 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  29.27 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6950  hypothetical protein  34.03 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  29.7 
 
 
229 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  28.44 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  33.64 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  24.48 
 
 
600 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  28.87 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  26.96 
 
 
322 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0252  hypothetical protein  21.6 
 
 
238 aa  42.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0316112  normal  0.0914513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  29.07 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  33.05 
 
 
290 aa  42.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  28.07 
 
 
297 aa  42.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  31.79 
 
 
343 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  25.97 
 
 
267 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>