35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0961 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  551  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  39.01 
 
 
265 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  41.99 
 
 
289 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  41.64 
 
 
280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  41.99 
 
 
280 aa  185  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  40.56 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  37.46 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  39.93 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  35.71 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  34.29 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  27.4 
 
 
264 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  31.29 
 
 
221 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  30.6 
 
 
223 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  30.6 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  28.93 
 
 
234 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  32.52 
 
 
229 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  30.43 
 
 
222 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  33.19 
 
 
219 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  29.39 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  28.93 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  27.57 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  29.5 
 
 
221 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  33.09 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  27.07 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  26.94 
 
 
240 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  26.88 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  24.83 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  28.87 
 
 
350 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  25.84 
 
 
258 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  34.91 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  29.46 
 
 
323 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  23.57 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  27.62 
 
 
417 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  28.15 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  23.17 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>