63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1909 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  602  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  32.06 
 
 
297 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  31.03 
 
 
347 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  30.69 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  29.84 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  27.54 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  30.3 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  24.11 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  23.76 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  23.76 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  23.76 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  23.43 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  29.85 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  23.76 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  29.26 
 
 
417 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  27.19 
 
 
262 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  26.1 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1396  hypothetical protein  23.63 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.107997  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  22.77 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  25.5 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  22.33 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  32.64 
 
 
348 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  28.63 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  19.53 
 
 
257 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  22.77 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  23.24 
 
 
315 aa  59.3  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  24.6 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1031  hypothetical protein  27.17 
 
 
462 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal  0.565046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  25.14 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  27.65 
 
 
268 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  25.65 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11203  hypothetical protein  22.45 
 
 
368 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  23.95 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0031  hypothetical protein  33.86 
 
 
289 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000287545  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  29.79 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  23.53 
 
 
417 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  34.91 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  27.22 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  30.46 
 
 
273 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  24 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  23.79 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  24.27 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1322  hypothetical protein  20.74 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  22.22 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  32.97 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  28.93 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  27.78 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  25.37 
 
 
297 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  22.84 
 
 
258 aa  46.6  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94419  predicted protein  25.94 
 
 
2525 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  27.69 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  24.14 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  22.83 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0639  hypothetical protein  24.72 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0502  hypothetical protein  22.05 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000554513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  29.29 
 
 
229 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  30.33 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  24.42 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  39.53 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  34.41 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1068  hypothetical protein  29.57 
 
 
344 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.410359  hitchhiker  0.00000295317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  22.63 
 
 
276 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>