31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5832 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  31.8 
 
 
281 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  33.57 
 
 
290 aa  134  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  30.63 
 
 
282 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  34.51 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  35.65 
 
 
234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  32.87 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  31.12 
 
 
280 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  33.96 
 
 
265 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  32.4 
 
 
289 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  37.77 
 
 
221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  34.21 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  34.21 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  35.22 
 
 
212 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  36.48 
 
 
219 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  32.44 
 
 
222 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  36.28 
 
 
221 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  28.47 
 
 
296 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  31.08 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  24.81 
 
 
264 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  29.41 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  26.95 
 
 
281 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  38.3 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  34.83 
 
 
274 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  31.25 
 
 
343 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  25.19 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  27.8 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  28 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  35.04 
 
 
350 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  31.78 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>