23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2782 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  464  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  57.87 
 
 
223 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  56.48 
 
 
223 aa  235  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  52.91 
 
 
221 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  49.56 
 
 
219 aa  188  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  49.54 
 
 
221 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  47 
 
 
222 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  44.93 
 
 
225 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  37.79 
 
 
280 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  31 
 
 
289 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  27.99 
 
 
296 aa  88.2  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  31.94 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  28.78 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  32.73 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  33.03 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  31.1 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  29.58 
 
 
290 aa  72  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  29.41 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  27.86 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  26.57 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  24.4 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  37.11 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>