28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5014 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  97.31 
 
 		 223 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  67.26 
 
 		 221 aa  292  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  65.32 
 
 		 219 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  63.68 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  58.74 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  58.56 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  57.87 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  41.67 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  36.94 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  33.69 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  35.4 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  32.31 
 
 		 265 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  30.6 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  31.54 
 
 		 281 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  30.11 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  29.82 
 
 		 296 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  34.21 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  30.74 
 
 		 264 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  24.45 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  26.09 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  27.53 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  31.03 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  27.87 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  32.61 
 
 		 297 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>