57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0041 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  57.5 
 
 		 280 aa  315  5e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  51.59 
 
 		 282 aa  262  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  47.5 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  43.06 
 
 		 265 aa  218  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  43.71 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  39.65 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  41.64 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  34.29 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  35.94 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  39.09 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  30.39 
 
 		 234 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  32.5 
 
 		 219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  31.12 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  36.41 
 
 		 222 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  34.86 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  36.02 
 
 		 212 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  34.12 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  26.6 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  32.04 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  29.14 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  30.14 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  28.38 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  29.52 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  30.17 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  30.96 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  29.22 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  27.68 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  31.21 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  31.71 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  25.2 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  29.19 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  29.85 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  24.36 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  31.82 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  25.82 
 
 		 417 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  30.3 
 
 		 417 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  30.65 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  30.53 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  36.97 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  26.12 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  36.89 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  28.71 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  28.71 
 
 		 318 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  28.71 
 
 		 318 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  28.71 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  26.04 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0163  hypothetical protein  32.22 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  24.63 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  26.43 
 
 		 456 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  23.53 
 
 		 600 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  26.32 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  26.46 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  22.39 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  21.83 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  26.53 
 
 		 318 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>