27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7475 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  66.52 
 
 
222 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  63.93 
 
 
221 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  58.56 
 
 
223 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  56.76 
 
 
223 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  53.64 
 
 
221 aa  214  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  51.36 
 
 
219 aa  198  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  44.93 
 
 
240 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  33.64 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  33.18 
 
 
280 aa  98.6  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  29.41 
 
 
281 aa  98.2  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  35.59 
 
 
282 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  30.57 
 
 
281 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  30.4 
 
 
289 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  31.96 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  32.04 
 
 
280 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  33.17 
 
 
290 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  28.11 
 
 
296 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  33.04 
 
 
265 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  31.17 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  31.08 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  27.27 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  22.79 
 
 
298 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  34.15 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  24.3 
 
 
307 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  24.36 
 
 
274 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  27.66 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>