58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7593 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  38.08 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  36.88 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  35.94 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  34.86 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  36.75 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  34.98 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  34.29 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  32.14 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  32.98 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  31.88 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  35.48 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  32.25 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  35.94 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  29.71 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  33.62 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  30.57 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  29.06 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  34.63 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  28.89 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  29.28 
 
 		 343 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  26.95 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  29.61 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  28.22 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  24.75 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  34.45 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  25.84 
 
 		 456 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  21.91 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  24.62 
 
 		 315 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  23.9 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  29.66 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  23.03 
 
 		 417 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  22.36 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  35.37 
 
 		 348 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  28.71 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  30.23 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  34.39 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  21.77 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  29.63 
 
 		 323 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  21.37 
 
 		 318 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  21.77 
 
 		 318 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  26.26 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  30.29 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  26.99 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  22.71 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  25.73 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  21.77 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  25.55 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  25.09 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2888  hypothetical protein  30.37 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  21.37 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  22.59 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  21.77 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  24.44 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  23.02 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>