35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09520 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  35.07 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  34.04 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  25.1 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  23.53 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  33.72 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  32.78 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  26.7 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  28.99 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  32.09 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  28.65 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  28.18 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  25.5 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  24.14 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  29.23 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  23.04 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  24.5 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  25.86 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  27.22 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  27.53 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  31.56 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  24.5 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  25.39 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  23.27 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  24.56 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  23.65 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  24.32 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  26.19 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  23.27 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  24.2 
 
 		 315 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  22.06 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  25.88 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  25.47 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  21.21 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  29.68 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>