24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1268 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  525  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  36.94 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  33.69 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  31.47 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  30.6 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  31.9 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  30.53 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  28.99 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  30.73 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  30.04 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  28.78 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  26.95 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  28.78 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  28.78 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  24.4 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  28.29 
 
 		 318 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  25.84 
 
 		 337 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  30.2 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  29.03 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  31.21 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  30.92 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  23.4 
 
 		 456 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  26.2 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  30.5 
 
 		 318 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>