41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3173 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  49.02 
 
 
315 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  50 
 
 
314 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  49.5 
 
 
312 aa  288  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  47.44 
 
 
315 aa  285  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  47.57 
 
 
318 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  47.9 
 
 
318 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  47.9 
 
 
318 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  46.93 
 
 
318 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  47.57 
 
 
318 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  47.9 
 
 
318 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  46.93 
 
 
318 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  47.57 
 
 
318 aa  275  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  46.25 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  45.55 
 
 
309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  36.18 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  29.11 
 
 
322 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  28.16 
 
 
293 aa  99.4  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  29.47 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  26.69 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  28.65 
 
 
265 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  34.86 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  28.14 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  26.5 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  27.05 
 
 
600 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3221  hypothetical protein  25.77 
 
 
514 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  26.8 
 
 
254 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  31.97 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  28.24 
 
 
283 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  24.17 
 
 
358 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  33.02 
 
 
275 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  25.99 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  24.59 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  27.7 
 
 
293 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  25.82 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  22.22 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3351  hypothetical protein  26.42 
 
 
670 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  29.47 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  25.64 
 
 
417 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  24.22 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>