44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2613 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  44.05 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  45.93 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  44.37 
 
 		 318 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  44.37 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  43.73 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  46.18 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  44.67 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  44.67 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  44 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  42.81 
 
 		 312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  45.54 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  43.19 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  40.98 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  44 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  31.76 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  29.87 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  28.66 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  29.43 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  30.48 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  34.13 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  32.03 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  24.73 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  29.15 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  25.28 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  24.59 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  31.15 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  34.88 
 
 		 275 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  28.64 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  27.33 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  27.01 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  28.04 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  27.08 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  28.87 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  24.84 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  25.76 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3351  hypothetical protein  25.93 
 
 		 670 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  26.03 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  23.77 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  28.3 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2989  hypothetical protein  25.11 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  28.48 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  31.01 
 
 		 269 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>