49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1832 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  34.06 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  28.86 
 
 
288 aa  101  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  30.14 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  32.26 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  34.13 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  24.57 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  25.45 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  31.16 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  26.32 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0241  hypothetical protein  22.91 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.981785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  29.51 
 
 
297 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  24.71 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3341  hypothetical protein  21.79 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  0.171376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  22.61 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  25.99 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  24.45 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  24.19 
 
 
314 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  28.48 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  26.8 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  25.15 
 
 
318 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  23.78 
 
 
318 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  25.99 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  25.76 
 
 
318 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  23.78 
 
 
318 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  23.78 
 
 
318 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2436  hypothetical protein  26.67 
 
 
258 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  27.52 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  23.04 
 
 
276 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0639  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  26.52 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  26.56 
 
 
330 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  27.56 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  24.38 
 
 
318 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  28.28 
 
 
312 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  27.27 
 
 
315 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0163  hypothetical protein  29.84 
 
 
350 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  27.2 
 
 
358 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  27.49 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  29.5 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  25.4 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  28.67 
 
 
309 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4230  hypothetical protein  22.99 
 
 
396 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000155249  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  25.58 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2989  hypothetical protein  26.09 
 
 
359 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  21.18 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  28.38 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  28.81 
 
 
459 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  32.86 
 
 
257 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>