50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3622 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  98.43 
 
 
318 aa  627  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  98.11 
 
 
318 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  96.54 
 
 
318 aa  617  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  76.42 
 
 
318 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  76.1 
 
 
318 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  75 
 
 
318 aa  484  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  74.53 
 
 
318 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  73.9 
 
 
318 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  48.55 
 
 
312 aa  294  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  49.01 
 
 
314 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  47.02 
 
 
315 aa  285  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  46.6 
 
 
315 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  46.93 
 
 
313 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  45.52 
 
 
309 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  36.69 
 
 
321 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  34.42 
 
 
321 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  27.99 
 
 
322 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  25.44 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  24.52 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  23.43 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  29.88 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  25.09 
 
 
330 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  27 
 
 
358 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  26.67 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  30.66 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  23.75 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  24.43 
 
 
265 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  25.56 
 
 
348 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  25.61 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  23.92 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  23.78 
 
 
254 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  26.63 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  29.59 
 
 
347 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  28.29 
 
 
274 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  27.42 
 
 
274 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  29.9 
 
 
231 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  25.73 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  22.84 
 
 
260 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  24.77 
 
 
343 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  21.15 
 
 
257 aa  49.3  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  22.37 
 
 
417 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  23.65 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  29.05 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  24.64 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  25.26 
 
 
456 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  28.71 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  22.61 
 
 
417 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>