42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03770 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  42.58 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  34.6 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  29.71 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  29.11 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  28.96 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  28.98 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  27.83 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  28.3 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  27.39 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  28.16 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  27.99 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  29.35 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  29.03 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  28.97 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  28.39 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  28.94 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  25.87 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  28.11 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  26.32 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  25.44 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  23.5 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  24.66 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  26.58 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  25.13 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  36.63 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  28.12 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  22.58 
 
 		 284 aa  49.7  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  32 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  27.07 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  24.4 
 
 		 600 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  21.54 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  24.86 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  25.13 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  23.92 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  30 
 
 		 417 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  22.53 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  21.63 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2436  hypothetical protein  26.09 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  24.24 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  37.68 
 
 		 323 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>