18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0581 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  672    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  28.36 
 
 
276 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  29.95 
 
 
279 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3341  hypothetical protein  37.38 
 
 
259 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  0.171376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  32.26 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  28.46 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  24.38 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  33.01 
 
 
284 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0639  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  27.07 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  21.74 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  24.86 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  31.13 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  23.36 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  31.87 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  33.87 
 
 
323 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  24.19 
 
 
330 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>