12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3341 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3341  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  0.171376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  33.33 
 
 
276 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  33.47 
 
 
279 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  37.38 
 
 
335 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  30.25 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  27.16 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3342  hypothetical protein  30.83 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.162621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  25.38 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  21.79 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  24.5 
 
 
258 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  26.52 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  27.78 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>