27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1127 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  591  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  58.7 
 
 		 288 aa  330  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  27.99 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  31.85 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  28.86 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  25.15 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  28.35 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3341  hypothetical protein  27.16 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  0.171376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  26.71 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  23.92 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  23.92 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  23.92 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  25.49 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  21.17 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  27.21 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  26.76 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  21.46 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2166  hypothetical protein  29.71 
 
 		 370 aa  49.3  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  24.02 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  31.43 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  25.81 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  25.83 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  24.31 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  21.27 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  22.53 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  22.18 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  25.23 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>