65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4697 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  31.02 
 
 
308 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  28.09 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  41.1 
 
 
347 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  41.72 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  25.48 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  30.46 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  28.35 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  25.86 
 
 
318 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  27.73 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  25.44 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3341  hypothetical protein  25.38 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  0.171376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  24.71 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  30.67 
 
 
350 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  23.04 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  26.37 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  24.14 
 
 
318 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  24.35 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11203  hypothetical protein  30.28 
 
 
368 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  21.17 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  22.84 
 
 
318 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  26 
 
 
288 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  28.83 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1396  hypothetical protein  28.48 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.107997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  22.84 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  22.41 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  22.84 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0254  hypothetical protein  29.33 
 
 
400 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0611917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3728  hypothetical protein  27.61 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  29.01 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3378  hypothetical protein  27.51 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  26.67 
 
 
314 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94419  predicted protein  24.51 
 
 
2525 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  23.28 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3446  hypothetical protein  26.99 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3481  hypothetical protein  26.99 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.02728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  24.86 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3755  hypothetical protein  26.99 
 
 
267 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  21.08 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3709  hypothetical protein  26.99 
 
 
268 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12968e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3800  hypothetical protein  27.12 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  23.98 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  23.9 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3397  hypothetical protein  27.61 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3342  hypothetical protein  21.4 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.162621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  31.78 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3751  hypothetical protein  27.33 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0031  hypothetical protein  20.98 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000287545  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  20.78 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0241  hypothetical protein  30.43 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.981785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  32.88 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  24.1 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  26.32 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3486  hypothetical protein  31.43 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00830911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3467  hypothetical protein  31.43 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0746455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4165  hypothetical protein  30.23 
 
 
369 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.381239  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  24.31 
 
 
322 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  23.73 
 
 
298 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  23.79 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  23.24 
 
 
293 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4230  hypothetical protein  23.18 
 
 
396 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000155249  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0221  hypothetical protein  27.54 
 
 
312 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1515  hypothetical protein  26.72 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.113881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>